1993年12月，國務(wù)院批準(zhǔn)南充地區(qū)撤地設(shè)市，南充縣師范學(xué)校即劃歸南充市直管，并將“四川省南充縣師范學(xué)校”更名為“四川省南充師范學(xué)?！薄?/span> 二十世紀(jì)九十年代末，隨著全國各地農(nóng)村人口大量涌向城市和沿海地區(qū)，農(nóng)村中小學(xué)教育規(guī)模急劇萎縮，國家教育部開始進(jìn)行教育結(jié)構(gòu)布局調(diào)整，要求三級師范逐步向二級師范過渡。同時(shí)，國家對中等師范實(shí)行計(jì)劃內(nèi)外“并軌”招生制度，學(xué)生畢業(yè)后國家不包分配，自主擇業(yè)，雙向選擇。在時(shí)代的大變化中，許多中師轉(zhuǎn)變了辦學(xué)功能，改辦成中學(xué)、中專、或與其他學(xué)校合并。南充師范雖然是經(jīng)省市教育主管部門確定保留下來的為數(shù)不多的師范學(xué)校之一 ，但是，面對教育新形勢的挑戰(zhàn)，同樣遭遇了生存與發(fā)展的危機(jī)。為了突圍解困，做大規(guī)模、提升質(zhì)量，南充師范學(xué)校在保留和鞏固中等師范教育的基礎(chǔ)上，增設(shè)了小學(xué)教育大專、職業(yè)技術(shù)教育、國民（成人）教育大專等教育序列。2001年，經(jīng)四川省教育廳、四川省計(jì)劃委員會批準(zhǔn)，南充師范學(xué)校成為具有“五年一貫制”小學(xué)教育大專班招生資格的14所學(xué)校之一，在辦學(xué)規(guī)格上正式跨入高等教育序列。2002年6月，四川師范學(xué)院院長辦公會議決定，并報(bào)經(jīng)四川省教育廳備案，同意以南充師范學(xué)校為主體，組建“四川師范學(xué)院南充初等教育學(xué)院”，隨著四川師范學(xué)院升格為西華師范大學(xué)，又更名為現(xiàn)在的“西華師范大學(xué)南充初等教育學(xué)院”，招收五年一貫制小學(xué)教育專業(yè)大專班，保留“四川省南充師范學(xué)?！毙Ｃ＝刂?/span>2008年，南充師范學(xué)校已開設(shè)小學(xué)教育大專、中等師范、職業(yè)技術(shù)教育、國民（成人）教育大專等四大序列的50余個(gè)專業(yè)。
1、中等師范教育序列。包括普通師范、普通幼兒師范、雙語幼兒師范、藝體幼兒師范、信息技術(shù)教育、美術(shù)教育、音樂舞蹈教育、英語教育、體育教育等9個(gè)專業(yè)。中等師范教育序列的各專業(yè)，招收初中畢業(yè)生，學(xué)制均為3年，學(xué)生畢業(yè)后發(fā)給中等師范文憑。
2、大專教育序列。大專序列包括小學(xué)教育和學(xué)前教育大專，開設(shè)了中文與社會方向、數(shù)學(xué)與科學(xué)方向、計(jì)算機(jī)技術(shù)方向、音樂舞蹈方向、普通教育方向、英語方向、幼兒師范方向、體育方向、美術(shù)方向等9個(gè)專業(yè)方向。小學(xué)教育、學(xué)前教育大專序列的各方向，招收初中畢業(yè)生，學(xué)制均為5年，學(xué)生畢業(yè)后發(fā)給全日制大學(xué)?？莆膽{，優(yōu)秀畢業(yè)生可享受西華師范大學(xué)“專升本”的待遇。
3、職業(yè)技術(shù)教育序列。包括計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)工程、計(jì)算機(jī)運(yùn)用與維護(hù)、計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)管理、計(jì)算機(jī)軟件應(yīng)用技術(shù)、計(jì)算機(jī)信息管理、計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、裝飾設(shè)計(jì)與計(jì)算機(jī)應(yīng)用、多媒體技術(shù)與應(yīng)用、網(wǎng)頁制作與網(wǎng)站維護(hù)、平面設(shè)計(jì)、動漫制作、動漫設(shè)計(jì)與影視設(shè)計(jì)、數(shù)控專業(yè)、數(shù)碼加工、電腦制圖、數(shù)控加工與維護(hù)工程、機(jī)電一體化、模具設(shè)計(jì)與制造、物流管理、車鉗銑刨、電腦機(jī)械雕刻、現(xiàn)代辦公與文秘、旅游服務(wù)與飯店管理、電子商務(wù)、裝飾裝璜、金工專業(yè)、市場營銷、酒店管理、旅游管理、鐵路專業(yè)、工業(yè)工程管理、影視專業(yè)、廣告設(shè)計(jì)與制作、電腦美術(shù)設(shè)計(jì)、廣告策劃與設(shè)計(jì)等35個(gè)職業(yè)技術(shù)專業(yè)。職業(yè)技術(shù)教育序列的所有專業(yè)，招收初中畢業(yè)生的學(xué)制為3年，招收高中畢業(yè)生的學(xué)制為2年，學(xué)生畢業(yè)后發(fā)給職業(yè)技術(shù)教育中專文憑。
4、國民（成人）教育大專序列。學(xué)校與西華師范大學(xué)聯(lián)合開辦初中起點(diǎn)的“2+
5、南充市小學(xué)教師培訓(xùn)中心。1999年 月，南充市教委批準(zhǔn)，在南充師范學(xué)校成立南充市小學(xué)教師培訓(xùn)中心，兩塊牌子，一套人馬，合署辦公，由李祥文校長兼任培訓(xùn)中心主任。2000年，四川省教育廳發(fā)文建立“南充市中小學(xué)教師培訓(xùn)中心”，因省上只掛一塊牌子，而南充市中小學(xué)骨干教師市級培訓(xùn)任務(wù)又是由南充教育學(xué)院和南充師范學(xué)校分別承擔(dān)的，所以，經(jīng)市教委與省上協(xié)商后，將中學(xué)教師培訓(xùn)中心設(shè)在南充教育學(xué)院（現(xiàn)南充職業(yè)技術(shù)學(xué)院），由省上掛牌；將小學(xué)教師培訓(xùn)中心設(shè)在南充師范學(xué)校，保留原來由市教委所掛的“南充市小學(xué)教師培訓(xùn)中心”吊牌。在2000—2002年期間，小學(xué)教師培訓(xùn)中心先后為全市部分縣、市、區(qū)中小學(xué)和相關(guān)單位，開展了小學(xué)骨干教師培訓(xùn)班、計(jì)算機(jī)教師培訓(xùn)班、中小學(xué)校長崗位培訓(xùn)班、國營企業(yè)管理人員培訓(xùn)班共10期，培訓(xùn)學(xué)員500多人。2002年以后，因財(cái)政管理體制發(fā)生變化，市縣（區(qū)）兩級財(cái)政“分灶吃飯”，小學(xué)骨干教師的培訓(xùn)基本上都由各縣（區(qū)）教師進(jìn)修學(xué)校自己承擔(dān)了。
